熱點&rdquo
2014-04-26 23:31 來源:http://www.vipreactor.cn/ 閱讀: 次繼承選擇原“熱門”方向,就需要和全球許多學者搶時間,搶成果,搶機會。即便有一定成果,還會有與別人成果反復,經費不足,論文發表難題等危險,整體競爭壓力大,反而抑制了研究的“健康”進行。
處理海量的數據,需要的不僅是技巧和耐煩,還需要有如破案的靈敏度。“整個過程需要大批的統計知識和龐雜的數學盤算,最難的是把這些數字轉化成一個證據確實的故事。”楊云鋒用這樣的語言來形容:我們是偵察,來到了一個兇案現場,看到的是一堆陳跡,如刀、血跡、混亂的物品……從這些線索中回推還原當時的情況,推斷整個案情產生的過程。良多時候須要猜想,而且會還原好幾個故事,甚至因為現場不可逆性而無奈判斷哪個才是本相。因為氣候變化快,所有的采集的數據也是不可逆轉的,所以在對數據結果進行確破和判定時,要參考前人的結果,并作出理智的決議判斷。楊云鋒也對此有著本人的信念,“我們的上風是斷定力強,見多識廣,靈感多。”
游手好閑,偵破“案情”,還原“故事”
審時度勢,在“冷門”中追求“熱門”
這次關于青藏高原草原微生物功能多樣性的課題真正開始于楊云鋒回國之前。在國外,他通過配合者提供的樣品進行了一系列實驗,比如測試微生物在基因層面上調控碳、氮循環的機制等。最終這些實驗結果通過數字的變化出現,而如何把這些數字用最優地情勢表白出來,并讓人佩服則是這項課題最重要也最要害的一步。回國時,楊云鋒帶回來了一張包括幾十萬個數據的excel表,并領導高瑩開始分析。
當然,這些研究的利用價值目前并不明顯,還需要進行大量的工作。楊云鋒也提到這次的論文只是他們整個綜合名目中的一篇,他們也會陸續開展系列研究。課題組當初自己采樣,做實驗,主要實驗包含對微生物DNA提取,測序,取得基因信息;測定溫室氣體通量等。這些工作將豐盛環境微生物領域的研究基本,對宏觀現象給予解釋,并為國度的決策供給一定的參考根據。
楊云鋒在經由三思而行后,終于決議博士畢業后改變自己的研究方向——從醫學微生物轉到了環境微生物,從“熱點”跳到“冷門”。而跟著全球環境問題一直,環境掩護成為國際話題,環境微生物研究逐步受到關注。明智的取舍讓楊云鋒較早地跨入了這個主流領域,并找到了自己的興趣所在。目前他課題組的工作主要是利用環境基因組學技術等來研究在全球變化的條件下,環境微生物的響應以及全球變化對微生物功能的影響。簡略地說,就是研究微生物對全球變化的反饋機制。
“這個論文過程很長,處理數據用了一年,寫文章,改文章又花了一年。”她總結,“面對拒稿不能氣餒,刻薄的評審們在輔助你找新的思路。一定要堅持住,并不斷完美自己構思。”
森林、草原、農田等生態體系排放出來的溫室氣體,是全球溫室氣體排放的主要形成。而這些溫室氣體,很大一局部是由微生物排放的。而所謂生物多樣性,90%以上的生物多樣性是微生物多樣性。如今,我國利用微生物實現低碳減排的運用、微生物資源保護已經起步,好比克制草原、農田等生態系統溫室氣體排放已有一些治理辦法。
同時他也盼望,“青年學生應當防止功利心,而是保持自己的興致和幻想。做自己信任的事件,不被別人煩擾,讓自己的生涯有意思。”
2013年8月29日,清華大學環境學院楊云鋒研究組在《天然》旗下的The ISME Journal(國際微生物生態學會會刊)發表題為《青藏高原草原沿海拔梯度的微生物功能多樣性》(The microbial gene diversity along an elevation gradient of the Tibetan grassland)的研究論文,首次實現了對青藏高原微生物功能多樣性的調查,發現了其與環境前提、特殊是土壤氮循環之間的強烈相關性。
她剛進入課題組時面對這一堆數據,無論是專業常識仍是數據處理軟件上,都存在不足,壓力十分大。但艱苦重重的現狀并沒有打垮她,她通過書籍、材料、身邊的老師同學,一步一步探索,匆匆找到了研究的方法。最先要做的是對幾種數據前處置方法進行對照剖析,每種辦法得到的成果有差別,但各有其生態學意思,找準綜合較好的前處理方法是第一步。隨后是進一步分析每一個基因的碳氮循環等過程,并用圖表將其表征出來。
演繹地說,楊云鋒課題組主要關注了兩方面的問題:氣候變化如何影響微生物多樣性以及微生物排放溫室氣體的規律和影響,有助于人類對微生物質源進行維護和開發以及調控做作界的溫室氣體排放,保持環境可連續發展。
研通社記者 陳陸淼杜林霏 周格格
編纂:襄樺
記者走進清華大學環境學院專訪了楊云峰和他的團隊,凝聽一群求知者對這個領域摸索的故事。
知人善用,施展團隊最大能動性
“不同的工作需要不一樣的學生,比方有些工作需要在本地采樣,男生更合適,必定要勤勤奮懇,能刻苦刻苦,敢于去艱難的處所。又如有些工作需要從數據看問題,因此要的是愛好研究,有好奇心,樂意思考的學生。”總之,不同特點和優點的學生在一起,能夠各司其職,人盡其才,讓整個團隊發揮最大的作用,政府師資。
楊云鋒在和學生獨特工作中也有不少難忘的閱歷。他提到一次帶學生去青海海北站取研究樣本令人記憶深入。第一次去西藏,親自領會到了那里艱苦的環境,吃住條件都無比不好,3個人一起一周竟然才花了70元。然而他回想,固然他和學生都感到那幾天很苦,但是他們也感觸了科研精力的力氣,因為在那里他們看到長期駐留的研究者為了取樣,可能要一天24小時都在工作,或者在野外考核,時刻面對深谷上暗藏的陷阱等等。
這次論文的第二作者,2011級博士生高瑩先容全部組每周都會開組會,每個人輪流用英語講;平時也隨時探討,有問題即刻解決不拖拉;每周要寫講演匯報工作情形。“咱們每一天節奏很緊湊,工作多,因而團隊里從老師到學生每個人都很勤懇跟盡力,根本天天都有十多少個小時的科研時間。”她還提到,不僅和身邊的同窗常常探討,和老師也時常交換。有一段時光她做實驗,始終不能實現預期的目的,楊老師就陪她在實驗室重做實驗,最后終于發現是試驗設計的問題。
在這里他開端帶著一群學生開始對于青藏高原微生物功能多樣性的課題。
楊云峰研究組:偵探“世界屋脊”,開啟環境微生物范疇研究新思路
圖為青藏高原微生物群落構造與環境因子之間的強烈關系。
青藏高原是全球氣候變化的敏感地區,在從前三十年里升溫是世界平均程度的兩倍,影響到了周邊二十多億國民的生活。該文的研究表明,氣候變化會改變土壤微生物群落結構和溫室氣體排放,因此相關模型需要納入微生物因素,才干正確猜測這一地區將來的氣候變化。
繼2013年1月份在全球變化主流雜志Global Change Biology(寰球變化生物學)道了放牧對青藏高原草原泥土微生物的影響之后,楊云鋒引導的研究團隊考察了青藏高原草原微生物功能多樣性,應用時空調換的生態學方式,發明低溫對土壤微生物構成顯明的環境壓力。天氣變化對土壤氮循環影響顯著,參加氨化、硝化進程的功效基因與氧化亞氮的排放存在正相干性,而對碳輪回影響不大。從而說明了青藏高原迥異與世界其它地域的一個特色,就是氣象變更的影響主要不是表示在碳庫上,而是在氨氮等動物成長的基礎因素上。微生物功能基因的變化,是這個景象的微觀機制。
青藏高原高寒草甸約占青藏高原面積的三分之一,是一種典范的地輿類型。由于適度放牧和全球暖化等因素的影響,近年來,青藏高原草原呈現了明顯的變化。因此有必要對其可持續性發展做相關研究。同時,青藏高原上動植物、微生物等品種豐碩,而針對微生物的研究未幾。楊云鋒看到了青藏高原的價值,于是他又一次精確地選擇了詳細的研究對象。
青藏高原,中國最大、世界海拔最高的高原,總面積近300萬平方公里,均勻海拔4000~5000米,有“世界屋脊”和“第三極”之稱。是亞洲很多大河的發祥地。
“我喜歡這種狀況,茶不思飯不想,最后恍然大悟的感到。這種對好奇心的滿意是任何財產都替換不了的。”楊云鋒生機自己的學生也能有這樣的好奇心。因為故事的“難以還原”,學生一定要有自主的立異性,而且喜歡揣摩,頭腦一直在運行,吃飯洗澡都在思考。
現在浮現在讀者面前的是一張張美麗的圖表。楊云鋒指著論文中的圖介紹,這些都是在統計學上有明顯意義的結果,它們從定性和定量兩個角度明白地表明了研究成果。
而高瑩面對詳細的數據時又是怎樣的情況呢?
這也讓人好奇,楊云鋒組建了怎么一支研究步隊。
這樣一個多樣化的團隊總會產生很多故事,在研究過程中,他們樹立了“同甘苦,共患難”的戰友誼。
“研以至用”,開拓微生物研究新路
(清華消息網2月8日電)
2010年,一直期待回國發展的楊云鋒在留美十多年之后回到祖國,在清華大學環境學院開辦環境基因組學團隊。國家、學校和學院對他的工作給予了鼎力的支撐,提供了良好的條件和資源,這也動搖了楊云鋒的在科研方面勇敢開辟的信心。雖是下車伊始,卻也有一種強烈的歸屬感。
相反,抉擇絕對“冷門”的方向存在一定的優勢。由于“冷門”領域關注較少,進而未解決的問題較多;各方面競爭壓力小,便于真正發展翻新性研究。
針對一個大領域,要選擇怎樣一個切入點進行研究?這又是楊云鋒需要思考的下一個問題。
“在研究生口試時,你會挑選怎樣的學生參加您的團隊呢?”
楊云鋒本科從中國科大畢業后即在美國持續深造,在國外共做學術研討14年。在紐約讀博期間,他重要做癌癥方向的醫學微生物研究。雖小有成績但仿佛不激發動他心坎最大的熱忱。
緩緩地她找到了楊老師所描寫的科研的快活,邊學邊做,數據處理、尋找法則、編寫故事,許多的靈感也在一邊寫文章一邊看論文中發生。
“我們愿望我們的研究成果終極也能為人類所用,并增進人類的發展。”楊云鋒提出了自己的等待。
轉變現狀,尋找自己真正感興趣而且相信的方向!當時的楊云鋒思考著這樣一個問題。
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